本发明公开了一种用于脱壳后的全谷物颗粒的杂质清除机及其使用方法，涉及食品加工技术领域。本发明包括机体，机体内部通过隔板设置有进料腔室和集料腔室；进料腔室内的储料斗底部转动连接有间隔供料组件，储料斗底部固定有导料组件；隔板靠近集料腔室侧壁设置有颗粒吸附盘和气体浮动盘，颗粒吸附盘表面滑动配合有卸料组件；隔板表面转动连接有颗粒承载组件。本发明通过供气多孔结构、气体流通孔、颗粒承载盘、负压多孔结构、气压传感器和卸料组件的设计，使得颗粒承载盘上谷物在负压下吸附在颗粒吸附盘底部，在此过程中重量较小的谷壳等杂质被吸走，而重量较大的石子类杂质停留在颗粒承载盘内部，有效实现谷物中各种杂质的清除。