本发明公开了一种桃金娘酮工业化提取方法和桃金娘酮微胶囊的制备方法。桃金娘经机械破壁后进行造粒；颗粒经亚临界丁烷预提取分离低极性成分，收集余粕；余粕用二氯甲烷浸提桃金娘酮；二氯甲烷浸提部用真空快速柱层析法粗分桃金娘酮，以正己烷和乙酸乙酯混合溶剂作为洗脱剂，收集含桃金娘酮馏分；含桃金娘酮馏分再经真空快速柱层析法细分桃金娘酮，以正己烷和二氯甲烷混合溶剂作为洗脱剂，收集含桃金娘酮馏分。本发明还公开了一种桃金娘酮微胶囊的制备方法，其选择玉米醇溶蛋白和麦芽糖糊精为微囊壁材，柠檬酸为交联剂，以桃金娘酮为芯材，添加食品级单辛酸甘油酯和蔗糖脂肪酸酯为乳化剂和增塑剂，使用喷雾干燥机进行喷雾干燥，得到桃金娘酮微胶囊。