一种双电池结构的智能水表控制器盒，固定连接盒套在基表表头外侧，后部置有固定卡扣并夹紧基表上置有的铅封凸起以防止固定连接盒旋转；防尘盖安装在固定连接盒上方，灌封盒置有左、右两个竖直独立的电池仓，可安装两块锂电池,主板灌封盒下表面置有的定位柱插入灌封盒置有的定位孔中,电子主板安装在主板灌封盒内部,上盒安装在灌封盒上方并包裹住主板灌封盒，三者通过卡扣固定成为一体,控制器盒的双竖直电池仓结构，让智能水表可使用两块二号锂电池为其供电，且竖直安装锂电池的方式可最大限度的发挥电池功效，确保智能水表的使用寿命远高于国标要求，减少自来水公司上门更换电池的次数，节约人工成本提高效益。