本发明公开了一种病疫生猪的识别方法和识别系统。该识别方法采集第一养殖区内的第一视频K，识别生猪异常行为信息，转移存在生猪异常行为信息的生猪至第二养殖区。第二养殖区内视频采集单元获取第二视频P，根据电子标签与体温识别区的位置关系识别第二视频P的多个体温识别区，生成第二数据，发送至第二收发器。本发明的病疫生猪的识别方法实现了RFID射频数据与视频数据的共享，通过第一收发器和第二收发器辅助定位电子标签，快速识别生猪的体温识别区。通过两次筛查的方式判断生猪是否患有病疫，检验结果更加精确，便于养殖管理人员实时判断生猪病疫状态。