本实用新型公开了一种枸杞酵素发酵液双重过滤系统，包括混料罐、输送泵A、离心机A、中转罐、输送泵B、离心机B、成品储罐、灌装设备，所述混料罐的出口与离心机A的入料口通过输送泵A相连接；所述离心机A的分离液出口与中转罐的进口相连，所述中转罐的出口与离心机B的入料口通过渣浆泵B相连接，所述离心机B的分离液出口成品储罐的入口相连，所述成品储罐的出口与灌装设备相连。所述枸杞酵素发酵液双重过滤系统能够实现连续生产，生产能力大、单位能耗小、自动化程度高、节省人力，适用于工业的连续性生产作业。