本实用新型公开了一种枸杞原浆初加工原料除杂杀菌分选系统，包括底座，所述底座的顶部固定安装有机箱，所述机箱的右侧固定安装有下料槽，所述机箱的内底部固定安装有蓄水箱。该枸杞原浆初加工原料除杂杀菌分选系统，通过设置喷淋机构、微波杀菌筒、储存仓、第一滤板、第二滤板、辊轮，通过辊轮去除原料果梗后通过第一滤板、第二滤板过滤后杂质落入储存仓后原料经过微波杀菌筒杀菌后，下落至卸料板的顶部后通过喷淋机构喷淋清洗后再从下料槽处滑出，同时通过设置储存仓和卡块，在需要将储存仓内部的杂质进行清除时，通过拔起卡块使储存仓滑出，从而对落入储存仓内部的杂质进行清理，达到了一体化方便回收杂质的效果。