本发明提供了口蹄疫灭活病毒抗原的保护剂，该保护剂由下列组份组成：海藻糖、棉子糖、葡聚糖、山梨醇、甘露醇、肌醇、木糖醇、聚乙二醇3350、TPGS、蜂胶；其能使抗原保存时间延长，在生产过程和冷链运输过程中保护口蹄病毒146s抗原稳定；有利于建立口蹄疫病毒抗原库，提高口蹄疫病毒抗原液中146s抗原低温储存的稳定性。本发明还提供了含有该保护剂和口蹄疫灭活病毒抗原作为芯材的口蹄疫灭活病毒微胶囊疫苗和其制备方法。该疫苗经口服或注射免疫动物，可以在8周就能产生高滴度FMDV抗体且持续时间较常规油佐剂灭活疫苗更长，更快实现免疫保护；且无需佐剂直接注射免疫，还可通过饮水或采食对动物进行预防接种，临床操作方便。