本实用新型公开了一种制备益生菌的过滤装置，包括外壳、双向电动推杆、两组输送管路以及过滤机构,所述外壳包括罩板以及分别固定在所述罩板两端的两块端板，罩板的相对两侧均沿其长度方向开设通孔，两块所述端板上均开设导液孔,所述双向电动推杆固定在罩板外侧面，双向电动推杆的两个伸缩端分别与两组输送管路连接,所述输送管路位于两块端板之间、并分别与端板上的所述导液孔连通，输送管路包括串接的活动管以及伸缩管，其中，伸缩管的一端固定在端板内侧、并连通导液孔，活动管为硬管，活动管的外侧固定滑块，滑块的滑动配合于罩板同侧的通孔。本实用新型方便快速更换滤芯，操作简单方便，能够长时间使用。