本发明涉及一种防止晶体麦芽糖醇储存结块的方法，包括如下步骤：在线实时检测干燥后晶体麦芽糖醇的温湿度，在线温湿度计分别设置筛分包装处理条件、二次干燥处理条件和陈化处理条件，将在相应的温湿度条件下的晶体麦芽糖醇分别被输送进行筛分包装处理、二次干燥处理和陈化处理；检测二次干燥处理或陈化处理后的晶体麦芽糖醇的温湿度，符合筛分包装处理条件后再输送进行筛分包装处理，否则继续进行相应的处理，直至其符合筛分包装处理条件后再输送进行筛分包装处理。本发明根据预先设定的温湿度处理条件，将在相应的温湿度条件下的晶体麦芽糖醇分别被输送进行筛分包装处理、二次干燥处理和陈化处理，节约资源，降低生产成本，提高生产效率。