本发明提供一种高效燕窝挑毛系统及挑毛方法，其中一种高效燕窝挑毛系统，通过控制系统和图像采集装置自动识别浸泡液中的燕窝条和燕毛，然后通过吸附装置和吸筒吸取燕毛；通过吸筒吸取燕毛，一方面，避免了传统挑拣工具‑镊子难以夹取燕毛的缺点；另一方面，能够最大限度地保护燕窝条的完整度，不会造成燕窝条的损伤；通过设置合理的吸筒的直径，就能避免燕窝条被吸入吸附装置的问题。本发明提供的高效燕窝挑毛系统，将传统的手工挑毛转变为机械自动化挑毛，显著提高了挑毛效率。本发明提供的另外提供的挑毛，与上述高效燕窝挑毛系统结合，能够有效识别出燕窝与燕毛，大大减小了挑毛后的燕窝中的燕毛残余量和挑毛效率。