本发明公开了一种富含低聚半乳糖的牛奶的制备方法，包括下述步骤：（1）将生牛乳脱脂，得到脱脂牛乳和稀奶油；（2）将脱脂牛乳经过巴氏杀菌、纳滤浓缩，得截留液；（3）将乳糖酶A和截留液混合酶解，杀菌，冷却，得料液；（4）将乳糖酶B、料液和稀奶油混合酶解，第一次均质，灭菌，第二次均质，冷却，灌装。本发明制得的牛奶达到无乳糖（乳糖含量为0）和富含膳食纤维的宣称（低聚半乳糖含量≥3g/mL），制得的产品甘而不甜，常温货架期4个月内各指标含量和组织状态均一稳定。本发明解决了牛奶因为含有乳糖而容易发生乳糖不耐症的问题，并且在不外添加膳食纤维的情况下也能使牛奶富含膳食纤维，从而使牛奶真正达到集营养、健康和美味于一身。