本发明提供一种船用速冻氟泵制冷系统，涉及制冷技术领域，包括箱体，箱体的内部架设安装有电源组，电源组的顶壁表面连通有线路，线路的另一侧端口连通有电解室，电解室的外壁表面连通有集气箱，集气箱的顶部通过管道连通有容积式氢气压缩机，容积式氢气压缩机的另一侧表面通过气体输送管路连通有氟泵，氟泵的另一侧表面连通有气体制冷剂输送管道，气体制冷剂输送管道的内部安装设置有气液分离结构，气液分离结构的另一侧表面连通有液体制冷剂输送管道，液体制冷剂输送管道的另一侧端口连通有冷凝室，有效对内部水汽进行干燥处理，降低制冷效果溢散在船用储存时结冰结霜，减少工作人员在作业中滑倒受伤。