本发明涉及网络安全领域，提供一种基于网络通信的远程控制方法、系统及存储介质。所述方法包括：接收服务端发送的节点信息，产生随机数；对所述随机数进行加密得到第一加密信息，发送到服务端；接收服务端发送的第二加密信息，进行解密得到冗余的节点控制信息，所述第二加密信息由服务端对冗余的节点控制信息进行加密生成，包括节点控制信息以及随机插入节点控制信息中的随机数；对所述冗余的节点控制信息进行去冗余操作，滤除所述冗余的节点控制信息中的随机数，得到所述节点控制信息；根据所述节点控制信息执行所述服务端的远程控制操作。本发明采用加密和冗余相结合的方式，降低信息泄露的风险，提高远程控制的安全性。