本发明公开了一种ECM电机电流处理系统及其工作方法，涉及电机领域。目前，采样电阻采样电流不能兼顾精度和电流偏置问题。本发明包括：主控制算法单元，包括速度环、电流磁链控制器模块和观测器模块；坐标变换单元，与主控制算法单元相连，其分为正向和逆向坐标变换；SVM调制逆变单元，与坐标变换单元输出端相连，用于空间矢量脉冲宽度调制及逆变；电流采样单元，通过电流传感器、采样电阻对电机三相进行电流采样；电流处理单元，输入端与电流采样单元相连，输出端与坐标变换单元相连，用于电流自适应和电流重构。本技术方案避免产生电流偏置问题，提高准确性。而且当占空比大到一定值时，电流自适应切换到电流重构，扩大了电流使用范围。