本发明提供了一种利用工业废水生产单细胞蛋白的方法，所述方法包括：在基础培养基存在下，将解脂耶氏酵母进行发酵培养；发酵培养至菌体OD值为30~50后，补加辅培养基，继续发酵培养，发酵完成后，得到所述单细胞蛋白；所述基础培养基包括工业废水、乙酸钠和甲酸钠。本发明中，所述方法将有机废水的处理与资源化开发利用相结合，以工业废水配制为培养基，用于生产单细胞蛋白，既能高效降解废水中的COD，有效的减少废物排放及二氧化碳的产生，解决废水排放问题；又能生产单细胞蛋白，实现了资源的合理化利用，避免了资源浪费。