本实用新型涉及一种文档安全扫描方法及系统，属于计算机外部输入设备和信息安全技术领域。本实用新型的安全扫描系统包括单片机、扫描装置、成像透镜、光电图像传感器、加密协处理器和通用串行总线接口。本实用新型提出的安全扫描系统具有身份认证和数据加密保护功能，有效解决了现有扫描仪易于被非法用户使用和信息容易泄露的问题，确保授权用户才能使用扫描仪，并防止扫描信息在传输过程中的泄露。本系统中的数字图像加密过程在扫描仪内部进行，不进入计算机环境，完全杜绝黑客程序的跟踪和攻击，有效提高安全扫描仪的安全防护级别。