本发明提供了一种基于分子网络的乳品中磷脂的检测方法，包括如下步骤：A）对乳品采用溶剂提取，分离得到磷脂提取物；B）将磷脂提取物采用UHPLC‑MS进行检测分析，得到色谱数据和质谱数据；C）采用MS‑DIAL对色谱和质谱数据进行峰提取、解卷积、化合物识别和峰对齐处理，得到二级质谱图和特征量化表；D）利用GNPS平台整合二级质谱图和特征量化表绘制分子网络，联合MS‑DIAL和分子网络方法进行定性分析；E）根据所述定性分析结果，提取化合物对应的MS峰面积进行相对含量的计算。本发明提供的分析方法操作简单，分析的磷脂种类多，鉴定结果准确可靠，方便快捷。