本发明实施例涉及种富含乳脂肪球膜蛋白、磷脂和低聚糖的婴幼儿配方奶粉，所述婴幼儿配方奶粉以生牛乳为原料、通过配方调整提升具有特殊功能成分的生物活性物质MFGM‑蛋白，乳铁蛋白（LF）、α‑乳白蛋白（α‑La）、总低聚半乳糖（GOS）、总多聚果糖、唾液酸、总磷脂、鞘磷脂（SM）、卵磷脂（PC）、磷脂酰丝氨酸（PS）、磷脂酰乙醇胺（PE）和磷脂酰肌醇（PI）、神经节苷脂（Gang）、甘油三职（TAG）、甘油二脂（DAG））的含量，达到促进婴儿肠道菌群中益生菌的定植尤其显著富集肠道内的乳酸菌同时减少未分类菌科等杂菌，提高肠道中免疫因子的含量和降低肠道疾病发生率的目的，该配方适用于婴儿和较大婴儿配方乳粉的开发。