本发明涉及一种液态物料柔性灌装系统，涉及食品加工领域，用于串联到原有灌装管线上，原有灌装管线上包括灌装臂和包装瓶，包括PLC控制器、若干带有识别码的物料罐、与每个物料罐连接的输送管、与若干输送管连接的连接阀、若干混料桶、带动混料桶转动的转盘、清洗设备、及与PLC控制器连接的识别器；每个输送管上还设有电动阀和流量计，所述电动阀和流量计与PLC控制器连接；所述连接阀的出口可根据转盘的转动对应输入到相应混料桶中；所述识别器用于识别物料罐的物料信息并传到PLC控制器；所述PLC控制器的控制模块和配方选择模块配合完成多个配方的切换和灌装。本发明能实现食品大型生产中柔性化，提升生产效率。