本发明公开了一种利用益生菌发酵提高金线莲活性成分含量的方法，包括以下步骤：（1）制备种子液：将经过活化的凝结芽孢杆菌、乳酸菌分别接种至相应液体培养基，在适宜条件下培养，制成种子液；（2）原料处理：将金线莲药材先进行低温真空干燥处理，再进行超微粉碎处理；（3）复合菌种分段发酵：制备含有金线莲超微粉的发酵培养基，先接入凝结芽孢杆菌进行发酵，再将接入乳酸菌进行发酵；（4）发酵完成后，将所得发酵产物进行冷冻干燥。本发明综合利用超微粉碎技术和微生物发酵技术，利用凝结芽孢杆菌和乳酸菌分段发酵使金线莲中主要活性成分得到较大程度的释放，发酵后金线莲苷、黄酮和多糖的含量均有明显提高。