本发明公开了一种从植物中制备蛇床子素的方法及在制备化妆品中的应用。本发明先对含蛇床子素的植物果实部位进行预处理，然后经过乙醇提取、液渣分离、蛇床子素粗体沉析、精准浓度的乙醇结晶与重结晶等步骤，获得蛇床子素单体活性成分。本发明提供的方法不仅可将杂质有效祛除，而且蛇床子素的转移率高。获得的成分具有抑菌抗炎、杀虫止痒、抗过敏、解痉降压、抗心律失常、增强免疫功能等功能，可以制备成乳化体系、表面活性剂体系，作为抗过敏、杀虫止痒、抑菌抗炎、去粉刺等功效的美容护肤用品。