本发明涉及微生物发酵技术领域，具体涉及一种透明质酸钠微生物发酵生产系统，包括：电动步进转盘、发酵装置和驱动装置，所述电动步进转盘可定位承载多个环形布置的发酵装置；所述驱动装置包括电动上齿圈和与电动上齿圈啮合的多个齿轮，所述电动上齿圈可绕自身轴线旋转，且齿轮与发酵装置一一配合使用；所述发酵装置包括发酵箱，所述发酵箱内在电动步进转盘径向上依次设置有传矩效率调节组件与搅拌组件，所述搅拌组件包括气密转动设置在发酵箱远离电动步进转盘轴线一侧的搅拌轴。本发明实现根据微生物生长周期自动适应性调节搅拌速度，避免搅拌前期过快、后期过慢而影响发酵产率、纯度和质量。