本发明涉及一种交互式牙齿分割方法、装置和处理系统，属于图像处理技术领域，解决了现有方法存在局部牙齿分割错误等的问题。该方法包括：在2D空间和3D空间中显示参考图像和患者图像；对2D空间中的两个或多个不合格子对象分别设置两个或多个标记并将两个或多个标记划分为两个或多个标记集；根据两个或多个标记集将患者图像中一个或多个子对象分割和/或合并为两个或多个子部分并利用两个或多个子部分实时更新患者图像；在更新患者图像后，用户根据在2D空间和3D空间中显示的患者图像交互式地增加、删除或调整标记，并重复以上分割和/或合并和更新步骤。通过对不合格子对象设置标记修正牙齿错误分割区域以减小工作量并提高牙齿实例分割精度。