本发明公开了一种复方木尼孜其制剂的指纹图谱检测方法，该方法取复方木尼孜其颗粒作为供试品溶液，再取哈马林作对照品溶液；分别取对照品溶液与供试品溶液注入高效液相色谱仪，记录60分钟内的色谱图，用指纹图谱软件对图谱进行处理，通过对比所得复方木尼孜其制剂的指纹图谱，确定共有峰9个，得到标准指纹图谱。本发明所述方法建立的复方木尼孜其制剂HPLC指纹图谱与对照图谱的相似度均大于0.9，能有效的表征其质量，有利于全面监控产品的质量；避免了复方木尼孜其制剂质量控制的单一性和片面性，减少了人为处理产品质量达标的可能性。该方法简便、稳定、精密度高、重现性好，能从整体特征面貌上控制复方木尼孜其制剂的质量，为复方木尼孜其制剂的质量控制提供科学的依据。