本发明公开了一种基于多卷积核的公章图像真伪鉴别方法及系统，该方法包括以下步骤：采集合同的多个公章图像，利用多个卷积核对每个公章图像进行图像过滤处理，以得到过滤结果；将过滤结果进行减除，以得到基于每个卷积核的减除结果；判断基于每个卷积核的减除结果是否均为非显著结果，如果是，则生成并发送伪公章鉴别结果；如果否，则将每个减除结果进行图像划分，并计算每个划分后的图像的区域熵，将各个区域熵进行对比，判断对比是否显著，如果是，则生成并发送真公章鉴别结果；如果否，则生成并发送伪公章鉴别结果。本发明利用多种卷积核全面地对公章图像进行过滤，更加精准全面的考虑公章的差异性，为公章的真伪鉴别提供有效的支持。