本发明公开一种辊轴式纸品自动侧定位输送系统，该系统包含运送组件和侧定位组件；侧定位组件的出口与辊轴式纸品自动侧定位输送系统的出口对应设置；侧定位组件包含定位挡板，该定位挡板平行于辊轴式纸品自动侧定位输送系统的出口方向，并与运送组件的运送方向之间设有可调节的夹角；运送组件运输纸品向其运送方向前进，该运送方向包含有朝向辊轴式纸品自动侧定位输送系统出口和定位挡板的分量。本发明解决了因底纸宽度尺寸误差大和堆纸侧面不齐而导致的底纸与面纸贴合后侧面误差大的现象，提高了底纸与面纸贴合后的精度。