本发明公开了一种酒糟小分子肽调味酒的制备方法，属于白酒生产及酒糟的处理技术领域。本发明的方法综合利用和提取酒糟中水溶性蛋白质，选择关键酶制剂水解蛋白质为小分子肽，并经过活性炭脱色及膜过滤除杂，制备的小分子肽调味酒能够满足酒体设计的调味使用，其原料为白酒蒸酒后的酒糟，与白酒具有“同源”性质，达到酒糟深度利用并兼顾“健康”与“调味”的目的。该方法采用绿色提取工艺路径，未使用任何化学试剂，最大限度的减少生产成本投入，适合产业化推广。