本发明公开了多微高温细菌香曲多阶段温控通风生产方法，属于酿酒技术领域。本发明首先是分别纯种单独培养高温细菌菌液，并经过二级扩大培养，得到多微高温细菌菌液；然后进行多阶段的控温连续通风或间歇通风培养，烘干后得到多微高温细菌香曲。本发明将优势的多微高温细菌利用全新的控温模式，在主动快速升温有效避免了杂菌感染的同时，多阶段梯度升温与通风模式保证了有益菌群对温度升高适应性，确保了菌体数量的增殖和代谢香味物质的产生与积累；所生产的多微高温细菌香曲酱香焦香浓郁香气典型，可用于绵柔型及其他类型白酒调味酒的生产，提高了经济效益。