本发明公开了一种电厂脱硫水在发酵罐灭菌工艺上的应用方法，属于生物发酵技术领域。用电厂脱硫水对发酵罐进行灭菌消毒，其工艺流程为：发酵结束后，用电厂脱硫水浸泡发酵罐（每批次电厂脱硫水95℃～105℃、20～30分钟)进行循环清洗(每隔3‑5批次更换电厂脱硫水)，然后进料，实消，发酵。该工艺技术操作方便，易于实现。本发明不改变生产工艺流程，只改变操作方式，在生产中实施后，同样可保证发酵过程的无菌效果。该方法的主要优点是：本发明不仅可以大量降低碱液和蒸汽的消耗，还可以减少非发酵周期时间和工人劳动量，提高设备利用率。