本发明公开了一种利用电厂脱硫水生产玉米淀粉的方法，属于生物发酵技术领域，用电厂脱硫水替代亚硫酸水用于玉米浸泡制备淀粉。该工艺技术操作方便，易于实现。与现有技术相比，所产生的有益效果是：本发明不改变玉米淀粉的生产工艺流程，只是适当调整电厂脱硫水配比，将其替代亚硫酸水生产玉米淀粉。在生产上实施后，同样可保证玉米淀粉质量和淀粉的抽提率。本发明不仅可以节省原料二氧化硫，而且也避免了液态二氧化硫和水调整配比时所造成的环境污染。同时，也提高了电厂脱硫水的附加值，减少污水的排放。