本实用新型公开了一种新型微生物发酵反应器，包括壳体结构的罐体，所述罐体的内壁贯穿设有进液管，所述罐体的内壁转动连接有方形结构的转换体，所述进液管在罐体内的一端贯穿转换体的侧壁，所述罐体的侧壁开设有人孔，所述人孔密封转动连接有罐门，所述罐体的底部设置有排污管，所述转换体远离进液管的一端连接有控制转换体转动的控制装置。本实用新型通过设置转换体，并将转换体内分为四个储物室，其中三个分别放置酸性物质、碱性物质、盐，使得水进入所需的储物室中后下落，起到控制罐体内待发酵原料pH和水分含量的作用，提高发酵效率，同时通过传动结构和联动结构使得工作人员仅需要转动长杆即可实现功能，方便操作。