本发明公开了一种微生物净水缓释装置及其制备方法和应用，包括保护壳体、保护剂、微生物菌粉和增殖促进剂，保护壳体内部容纳有保护剂、微生物菌粉和增殖促进剂，微生物菌粉和增殖促进剂包埋于定时缓释层中，本发明中的微生物净水缓释装置可以长时间保持在较高的水平，维持氨氮、亚硝酸盐与硝酸盐浓度处于较低的状态，投放后在很长的一段时间内不需要二次投放，为使用提供了极大的方便。