本实用新型提供一种疫苗注射装置，包括控制器、机架和设置在机架上的输送机构、注射机构，输送机构包括输送带，输送带设置在注射机构下方，注射机构包括升降平台、导向件、注液针头、第一升降装置和第二升降装置，导向件设置在升降平台上，注液针头设置在导向件内，导向件包括一底部开口的杯体，升降平台对应杯体的底部开口设有通孔，升降平台与导向件一体设置，第一升降装置与升降平台连接并驱动升降平台升降，第二升降装置与注液针头连接并驱动注液针头升降；输送带上设有存蛋架，存蛋架上设有存蛋槽，存蛋槽一一对应于导向件设置，使得存蛋槽可与导向件一一吻合，禽蛋定位准确并可自动进行胚胎疫苗注射。