本发明公开了利用鱼类下脚料和固定化酶制备缓释性海参饵料的方法。其解决现有鱼类下脚料直接投喂海参无法消化利用的问题。其是在培养基中接种鱼肠道中分离筛选得到的产蛋白酶菌株，培养出种子菌液；将鱼类下脚料肉糜放入种子菌液中发酵，形成发酵液；将壳聚糖溶液注射到氢氧化钠和甲醇混合溶液中，凝结成中空球形壳聚糖载体；载体放入戊二醛水溶液中活化；将酶包裹在空心球壳聚糖载体中，形成固定化酶；再将固定化酶与发酵液投放到海参养殖水域。本发明的方法工艺合理，操作可行。其固定化酶的稳定性高，半衰周期长，对鱼类下脚料发酵液缓慢酶解，释放海参饵料，同时对沉积的残饵起到降解作用，减少了投饵次数，降低人工成本。