本发明公开了一种从刺参体腔液中提取抗菌组合物的方法、其组合物及用途。其方法经过以下步骤：（1）提供新鲜刺参，温和冲洗，使用螺旋藻饲喂并且停止喂食12‑24小时；（2）将步骤1得到的刺参通过温度变化、水体盐度改变、轻微电刺激，或取内脏器来进行排脏；（3）收集刺参排脏之后的饲养水体，过滤并且收集滤液，浓缩得到浓缩液；（4）将浓缩液提取干燥得到产品。本发明的提取方法步骤合理、技术先进、操作可行。制备的组合物可以广泛用于灭杀细菌或者真菌的用途，其具有较好的抗菌效果，并且具有较低的过敏反应性，因此可以广泛用于创口消毒等用途。