本发明公开了一种基于视频图像的眼动追踪方法和系统，获取人脸的视频图像，间隔提取视频图像中的一帧进行预处理；提取预处理后的图像中的人脸区域、左眼区域和右眼区域；将提取的所述人脸区域、左眼区域和右眼区域输入预训练的卷积神经网络，得到卷积神经网络输出的视线方向；基于预先标定的映射函数，将卷积神经网络输出的视线方向映射至屏幕，输出人眼在屏幕上的视点坐标，完成眼动追踪。本发明利用普通的图像采集设备即可实现眼动追踪，并且追踪准确率高。