本发明涉及了一种直流电源系统及其控制方法，该控制方法包括：S10.分别采集直流母线电压及前i个蓄电池串联后的电压，i＝N、N+1、…、N+M，其中，N+M个蓄电池串联，且第一个蓄电池的负极连接负直流母线，N、M分别为大于等于1的自然数；S20.根据所述直流母线电压及所述前i个蓄电池串联后的电压，控制M+1个串联控制电路的通断，其中，M+1个串联控制电路分别设置在第i个蓄电池的正极与正直流母线之间。实施本发明的技术方案，可确保直流母线上的系统设备正常运行，使直流母线抗冲击能力强，降低直流母线失电的概率，有效地提高了直流电源系统的可靠性。