本实用新型公开了一种电泳工序的节水系统，包括依次设置的电泳槽、第一超滤槽、第二超滤槽、第三超滤槽、以及若干水洗槽，水洗槽的数量至少为两个其中包括第一水洗槽和第二水洗槽；还包括维护系统，维护系统包括置换槽以及依次连通的第二超滤装置和纯水超滤装置，第二超滤装置与第二超滤槽连通，纯水超滤装置与第一水洗槽和第二水洗槽连通，置换槽分别与第一水洗槽和第二水洗槽连通，置换槽还与第二超滤槽相连通。本实用新型利用置换槽电泳工艺的维护状态下对第一水洗槽和第二水洗槽排出的溶液进行回收，然后利用第二超滤装置和纯水超滤装置进行过滤从而重复利用第一水洗槽和第二水洗槽内的水，减少废水的排放以及纯水的用量。