本发明公开了一种基于微服务架构的批量清算系统。该系统包括：订单微服务子系统，用于对所外接的第三方交易平台发送的第三方交易订单进行数据转移和对账处理；清分微服务子系统用于对所外接的核心系统发送的交易订单进行第三方清分、第三方对账和第三方结算；清算微服务子系统用于对接收到的交易订单进行分行清分和、分行结算处理；结算微服务子系统用于对所外接的第三方交易平台发送的第三方交易文件进行结算处理。本发明实施例通过微服务架构对订单微服务子系统、清分微服务子系统、清算微服务子系统和结算微服务子系统进行布局，实现了通过微服务集中统一管理清算业务，提升了电子商务支付系统中清算应用的可扩展性和健壮性。