本发明公开了一种海洋地震节点的时钟校准系统，该系统包括：天线模块、与天线模块连接的多个时钟源、与每个时钟源连接的多个脉冲分配器、与每个脉冲分配器连接的多个海洋地震节点、与多个海洋地震节点连接的服务器，其中，天线模块用于采集第一时间脉冲信号；时钟源用于获得与第一时间脉冲信号同步的多路第二时间脉冲信号；脉冲分配器用于将每路第二时间脉冲信号分配成多路第三时间脉冲信号；服务器用于生成时钟校准指令，向海洋地震节点发送时钟校准指令；海洋地震节点用于根据时钟校准指令和第三时间脉冲信号，校准本地时钟。本发明可以实现大规模的海洋地震节点的时钟校准，提高时钟校准的效率和准确性。