本实用新型涉及一种水流流量监测电路及医疗设备冷却系统，水流流量监测电路包括：水流传感器和流量监测电路，所述流量监测电路包括电连接的滤波电路和稳态电路，所述水流传感器电连接至所述滤波电路，其中，所述水流传感器通过对流量变化的感应生成脉冲信号。本实用新型基于水流传感器，将水流传感器监测到的脉冲信号传输至流量监测电路，对水流传感器安装位置与方向要求灵活，流量监测电路对气泡的误报率低，抗干扰强。