本发明涉及金属表面处理技术领域，尤其涉及一种用于去除金属表面有机物的微生物制剂及其制备方法，本发明的一种用于去除金属表面有机物的微生物制剂，包括以下重量份原料：微生物菌剂20‑30份、表面活性剂8‑15份、营养液10‑20份、葛根提取物3‑5份、改性载体纤维5‑10份、水15‑25份，所述改性载体纤维为葛根纤维经过聚乙二醇接枝改性而得。本发明制备得到的一种用于去除金属表面有机物的微生物制剂，通过添加葛根提取物和改性载体纤维能够有效提高微生物制剂和金属表面有机物之间的附着力，更有利于微生物制剂和有机物之间相作用，有利于提高去油效率和去油效果。