一种烧结钕铁硼永磁材料自动充磁系统，包括：送料装置，送料装置具有第一整列轨道；整列装置，整列装置具有第二整列轨道且与第一整列轨道对接；充磁线圈组件，充磁线圈组件包括有充磁线圈以及充磁线圈轨道；推料装置，推料装置设置于充磁线圈轨道的尾端；接料盒，接料盒与充磁线圈轨道连接。本发明能在自动磁化处理生产线上大批量进行小尺寸待着磁工件的磁化处理。本发明在振动送料盘以及整列装置内进行两次整列操作，避免了工件之间的相互磕碰，降低了磁化过程中工件之间的磕碰，从而能够大幅降低磁化完成后工件成品外观尺寸的不良率。由于待着磁工件排列规整，还可以避免充磁过程中充磁不饱和的问题出现。