本实用新型公开了一种应用于PCB工艺制程的除菌装置，涉及PCB制程领域，其特征在于：该应用于PCB工艺制程的除菌装置，包括：进气管道系统，用于通入气体，输出给除菌发生器系统；电流输出控制系统，用于输出电流给除菌发生器系统；继电器系统，用于控制电流输出控制系统的开启和关闭；除菌发生器系统，用于通过高压电离和聚合反应生成除菌气体，对PCB板进行除菌；与现有技术相比，本实用新型的有益效果是：有效持续性除菌，抑制生产线细菌问题；通过布管可使气体均匀分布于水洗环境各角落，减少除菌死角；减少化学除菌带来的药品使用和废液处理量，有效节能减排；本实用装置安装简单，对设备线改造影响小，对管道进行调整即可使用，适合推广应用。