本发明涉及双集群间服务器动态分配方法及系统，其实现过程为在用户预先配置的基础上对服务器资源进行分配，形成主集群和副集群；在业务服务和任务服务运行的过程中，通过对主集群和副集群的负载状态进行监控，以主集群的负载状态情况为主，按需将主集群主机的闲置资源调整到副集群中，来提高服务器资源的利用率；同时，在主集群所需的服务器资源不能得到满足时，及时从副集群中调配迁移。本发明通过对主集群和副集群的负载情况进行定时监控，在主集群的负载处于非预期最佳负载状态时触发服务器动态分配，从而保持业务服务集群处于最佳负载状态，有效利用空闲集群的服务器资源，同时可在主集群处于高负载时予以快速响应。