本发明涉及一种逻辑隔离应用服务器间数据交换系统，包括一个数据交换服务器和多个应用服务器，多个应用服务器通过数据交换服务器连接，多个应用服务器通过数据交换服务器完成业务数据上传和业务数据接收，并且，每个应用服务器通过数据交换服务器完成密钥更新，其中，每个应用服务器包括：密钥协商模块，用于与数据交换服务器完成密钥协商；签名认证和加解密模块，用于对待交换的业务数据进行加密并生成签名，同时对接收到的业务数据进行签名认证和解密；数据传输模块，用于向数据交换服务器发送业务数据。本发明在单向数据访问请求的逻辑隔离网络下，通过充分利用互联网进行敏感业务数据交换，提高了数据交换效率，节省了敏感数据交换的成本。