本发明公开了一种互感器运行误差在线监测及计量方法，包括以下步骤：采集互感器二次侧的运行数据，构建标准数据集和检测数据集；基于所述标准数据集，构建互感器运行误差检测模型；基于所述检测数据集，通过所述互感器运行误差检测模型，得到无误差标准互感器组；将所述检测数据集按同相信号进行分组，并根据所述无误差标准互感器组计算各通道互感器的误差值，从而实现互感器运行误差的定量计算。本发明解决了如何准确且快速的对互感器运行误差进行在线监测并输出结果的技术问题。