本发明涉及一种基于多容器集群的工作负载组合统一部署方法及系统，其中方法包括：步骤1：响应外部用户应用后，根据外部用户应用中的微服务的相关信息，生成待填充的工作负载配置文件；步骤2：根据外部用户应用中的批次信息，将批次信息填充至工作负载配置文件中进行组合；步骤3：根据批次信息中的批次定制属性，将对应工作负载配置文件中的信息进行覆盖，得到完整的工作负载配置文件；步骤4：根据批次信息中的关联容器集群信息和每个容器集群本身的配置信息，将每一份工作负载配置文件生成真实的集群API访问接口配置并发送至对应的集群进行统一部署，同时本发明提供一种与方法对应的系统，与现有技术相比，本发明具有能够适用多地部署等优点。