本发明公开了一种板材加工设备及其操作方法，包括双轴立式镂铣床，双轴立式镂铣床的上端面的一侧固定有导轨，双轴立式镂铣床上端面的一侧活动设置有移动座，移动座的底部开设有配合导轨使用的导槽，移动座的两侧均固定有上顶板，每个上顶板的下端面均设置有U形毛刷层，每个上顶板的底部均对称固定有两个J形支撑架，每个J形支撑架上均设置有导料机构，移动座上对称设置有两个夹持机构；本发明在使用的过程中，移动座移动时，会带动U形毛刷层一起移动，从而使U形毛刷层可以将导轨上端面的木质碎屑进行清理，避免影响移动座在导轨上的移动效果。