本实用新型涉及一种燃料电池用密封压缩机，包括电机、齿轮箱和压缩机本体，所述齿轮箱包括齿轮箱壳体，所述齿轮箱壳体内转动设置至少一传动齿轮；所述压缩机本体包括压缩机本体壳体，所述压缩机本体壳体与所述齿轮箱壳体固定连接；所述压缩机本体壳体内转动设置至少一转子，所述电机的电机轴与所述传动齿轮传动连接，所述传动齿轮与所述转子传动连接；在所述齿轮箱与所述压缩机本体的连接端，所述压缩机本体壳体与所述转子的轴芯之间通过油封组件动密封。解决了现有技术中由于压缩机内的油封不能完全密封齿轮箱内的油使油泄露至压缩气体中，最终造成燃料电池汽车排放的废弃物产生污染的技术问题。